Elementy chemii obliczeniowej i bioinformatyki 0600-S2-ChK-EChOBI
Laboratorium (LAB) Semestr zimowy 2022/23

(do 65 tys. znaków)

Literatura podstawowa:

1. Chemia obliczeniowa w laboratorium organicznym, Anna Kaczmarek-Kędziera, Marta Ziegler-Borowska, Dariusz Kędziera, Wydawnictwo Naukowe UMK, Toruń, 2014.

2. Chemia organiczna (część 1), Jonathan Clayden, Nick Greeves, WNT 2014.

3. Białka i peptydy, Shawn Doonan, Wydawnictwo Naukowe PWN 2008.

4. Bioinformatyka. Podręcznik do analizy genów i białek, Andreas D. Baxevanis, B.F. Francis Ouellette, Wydawnictwo Naukowe PWN 2004.

5. Bioinformatyka i ewolucja molekularna, Teresa K. Attword, Paul G. Higgs, Wydawnictw Naukowe PWN 2011.

Literatura uzupełniająca:

1. Elementarne metody chemii kwanrowej, Andrzej J. Sadlej, Wydawnictwo Naukowe PWN 1969.

2. Elementy chemii kwantowej sposobem niematematycznym wyłożone, Włodzimierz Kołos, PWN, 1986.

3. Molecular orbitals and organic chemical reactions, Ian Fleming, Wiley 2010.

Zaliczenie pracowni odbywa się poprzez wykonanie projektu obliczeniowego.

Optymalizacja geometrii cząsteczki. Klasyfikacja stanów stajonarnych. Symulacja widma IR. Stany przejściowe, badanie przebiegu reakcji. Stany wzbudzone i widmo UV. Właściwości NMR. Przykłady zastosowań bioinformatycznych baz danych.

Metoda projektu, studium przypadku, dyskusja, pokaz