Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu - Centralny punkt logowania
Strona główna

Elementy chemii obliczeniowej i bioinformatyki 0600-S2-ChK-EChOBI
Laboratorium (LAB) Semestr zimowy 2022/23

Informacje o zajęciach (wspólne dla wszystkich grup)

Liczba godzin: 30
Limit miejsc: (brak limitu)
Zaliczenie: Zaliczenie lub ocena
Literatura:

(do 65 tys. znaków)

Literatura podstawowa:

1. Chemia obliczeniowa w laboratorium organicznym, Anna Kaczmarek-Kędziera, Marta Ziegler-Borowska, Dariusz Kędziera, Wydawnictwo Naukowe UMK, Toruń, 2014.

2. Chemia organiczna (część 1), Jonathan Clayden, Nick Greeves, WNT 2014.

3. Białka i peptydy, Shawn Doonan, Wydawnictwo Naukowe PWN 2008.

4. Bioinformatyka. Podręcznik do analizy genów i białek, Andreas D. Baxevanis, B.F. Francis Ouellette, Wydawnictwo Naukowe PWN 2004.

5. Bioinformatyka i ewolucja molekularna, Teresa K. Attword, Paul G. Higgs, Wydawnictw Naukowe PWN 2011.

Literatura uzupełniająca:

1. Elementarne metody chemii kwanrowej, Andrzej J. Sadlej, Wydawnictwo Naukowe PWN 1969.

2. Elementy chemii kwantowej sposobem niematematycznym wyłożone, Włodzimierz Kołos, PWN, 1986.

3. Molecular orbitals and organic chemical reactions, Ian Fleming, Wiley 2010.

Metody i kryteria oceniania:

Zaliczenie pracowni odbywa się poprzez wykonanie projektu obliczeniowego.

Zakres tematów:

Optymalizacja geometrii cząsteczki. Klasyfikacja stanów stajonarnych. Symulacja widma IR. Stany przejściowe, badanie przebiegu reakcji. Stany wzbudzone i widmo UV. Właściwości NMR. Przykłady zastosowań bioinformatycznych baz danych.

Metody dydaktyczne:

Metoda projektu, studium przypadku, dyskusja, pokaz

Grupy zajęciowe

zobacz na planie zajęć

Grupa Termin(y) Prowadzący Miejsca Liczba osób w grupie / limit miejsc Akcje
1 każda środa, 12:15 - 14:30, sala S223
Anna Kaczmarek-Kędziera 7/ szczegóły
2 każda środa, 9:45 - 12:00, sala S223
Dariusz Kędziera 6/ szczegóły
Wszystkie zajęcia odbywają się w budynku:
Wydział Chemii
Opisy przedmiotów w USOS i USOSweb są chronione prawem autorskim.
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu.
ul. Jurija Gagarina 11, 87-100 Toruń tel: +48 56 611-40-10 https://usosweb.umk.pl/ kontakt deklaracja dostępności mapa serwisu USOSweb 7.0.4.0-2 (2024-05-20)