Bioinformatics and Functional Genomics
Informacje ogólne
Kod przedmiotu: | 2600-OG-EN-BFG | Kod Erasmus / ISCED: |
(brak danych)
/
(0511) Biologia
![]() |
Nazwa przedmiotu: | Bioinformatics and Functional Genomics | ||
Jednostka: | Wydział Nauk Biologicznych i Weterynaryjnych | ||
Grupy: |
Przedmioty ogólnouniwersyteckie |
||
Strona przedmiotu: | http://www.genomics-lab.com | ||
Punkty ECTS i inne: |
1.00 ![]() |
||
Język prowadzenia: | angielski | ||
Wymagania wstępne: | Studenci zdobywają wiedzę z zakresu biologii i weterynaryjnej. |
||
Rodzaj przedmiotu: | przedmiot fakultatywny |
||
Całkowity nakład pracy studenta: | Godziny realizowane z udziałem - wykłady: 15 Godz. |
||
Efekty uczenia się - wiedza: | Wiedza: i) Ma pogłębioną wiedzę z dyscyplin kierunkowych umożliwiającą pracę badawczą i działania praktyczne w zakresie weterynaria i biotechnologii ii) Zna zaawansowane oprogramowanie i specjalistyczne narzędzia bioinformatyczne wykorzystywane w weterynaria i biotechnologii iii) Wybiera optymalne techniki molekularne i technologie wykorzystywane w badaniach materiału genetycznego iv) Proponuje tematy projektów badawczych lub aplikacyjnych w dziedzinach nauki właściwych dla studiowanego kierunku |
||
Efekty uczenia się - umiejętności: | Umiejętności: i) Stosuje zawansowane techniki właściwe do uzyskania założonych celów ii) Stosuje zaawansowane metody i techniki weterynaria i biologii molekularnej do rozwiązania zadania badawczego z dziedzin nauki właściwych dla studiowanego kierunku iii) Analizuje i interpretuje oryginalne prace badawcze zarówno w języku polskim jak i angielskim, iv) Formułuje i planuje samodzielnie zadania badawcze w dziedzinach nauk z zakresu weterynaria i biotechnologii wykonywane pod kierunkiem opiekuna v) Korzysta z pakietów oprogramowania do opisu uzyskanych wyników doświadczeń vi) Stosuje specjalistyczne narzędzia bioinformatyczne (BLAST, MIRA, Clustal, Muscle, pakiet PHYLIP) do otrzymania i analizy danych o charakterze specjalistycznym vii) Czyta ze zrozumieniem skomplikowane teksty naukowe w języku angielskim w zakresie dziedzin nauki właściwych dla studiowanego kierunku |
||
Efekty uczenia się - kompetencje społeczne: | kompetencje: i) Zna ograniczenia własnej wiedzy i rozumie potrzebę podnoszenia kompetencji osobistych ii) Jest świadomy postępu wiedzy w zakresie weterynaria i biologii molekularnej i biotechnologii, ale także ograniczeń jej wykorzystania w odniesieniu do człowieka i środowiska iii) Dostrzega relacje między rozwojem nowych technologii a podnoszeniem poziomu jakości życia. |
||
Metody dydaktyczne: | w formie "prezentacja power-point". |
||
Skrócony opis: |
Part-I: Analyzing DNA, RNA, and protein sequences in databases Part-II: Genome-wide analysis of RNA and protein Part-III: Genome analysis |
||
Pełny opis: |
Part-I: Access to sequence data and literature information, pairwise sequence alignment, basic local alignment search tool (BLAST), advanced database searching, multiple sequence alignment, Part-II: bioinformatic approaches to ribonucleic acid (RNA), gene expression: microarray data analysis and functional genomics, Part-III: completed genomes: viruses and bacteria, the eukaryotic chromosome, eukaryotic genomes: from parasites to primates and the human genome. |
||
Literatura: |
Textbook reading: 1. Bioinformatics and Functional Genomics: edited by Jonathan Pevsner, Wiley-Blackwell publisher. 2. Computational Text Analysis for Functional Genomics and Bioinformatics. edited by Raychoudhuri S., Oxford ebook lib. 3. Functional Genomics: A Practical Approach: Hunt and Livesey. Text books are available for the students at PGF. |
||
Metody i kryteria oceniania: |
Bieżące przygotowanie studentów do zajęć i ich aktywność, oraz w formie "prezentacja seminaryjna". |
||
Praktyki zawodowe: |
brak |
Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2020/21" (w trakcie)
Okres: | 2021-02-22 - 2021-09-20 |
![]() |
Typ zajęć: |
Wykład, 15 godzin ![]() |
|
Koordynatorzy: | Chandra Pareek | |
Prowadzący grup: | (brak danych) | |
Strona przedmiotu: | http://www.genomics-lab.com | |
Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
Zaliczenie: | Zaliczenie na ocenę | |
Skrócony opis: |
Part-I: Analyzing DNA, RNA, and protein sequences in databases Part-II: Genome-wide analysis of RNA and protein Part-III: Genome analysis | |
Pełny opis: |
Part-I: Access to sequence data and literature information, pairwise sequence alignment, basic local alignment search tool (BLAST), advanced database searching, multiple sequence alignment, Part-II: bioinformatic approaches to ribonucleic acid (RNA), gene expression: microarray data analysis and functional genomics, Part-III: completed genomes: viruses and bacteria, the eukaryotic chromosome, eukaryotic genomes: from parasites to primates and the human genome. | |
Literatura: |
Textbook reading: 1. Bioinformatics and Functional Genomics: edited by Jonathan Pevsner, Wiley-Blackwell publisher. 2. Computational Text Analysis for Functional Genomics and Bioinformatics. edited by Raychoudhuri S., Oxford ebook lib. 3. Functional Genomics: A Practical Approach: Hunt and Livesey. Text books are available for the students at PGF. | |
Uwagi: |
brak |
Zajęcia w cyklu "Semestr zimowy 2021/22" (jeszcze nie rozpoczęty)
Okres: | 2021-10-01 - 2022-02-27 |
![]() |
Typ zajęć: |
Wykład, 15 godzin ![]() |
|
Koordynatorzy: | Chandra Pareek | |
Prowadzący grup: | Chandra Pareek | |
Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
Zaliczenie: | Zaliczenie na ocenę |
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu.