Analiza strukturalna
Informacje ogólne
| Kod przedmiotu: | 0600-S2-CKR-SP/W-AS |
| Kod Erasmus / ISCED: |
13.3
|
| Nazwa przedmiotu: | Analiza strukturalna |
| Jednostka: | Wydział Chemii |
| Grupy: |
studia stacjonarne II stopnia, chemia kryminalistyczna semestr 2 |
| Punkty ECTS i inne: |
(brak)
|
| Język prowadzenia: | polski |
| Wymagania wstępne: | Znajomość matematyki i chemii na poziomie S1 oraz krystalochemii. |
| Całkowity nakład pracy studenta: | 1. 15h wykład, 45h laboratorium,15h konsultacje tj. 75 godzin kontaktowych, 2. 45h praca indywidualna, 3. 30h czas wymagany do przygotowania w procesie oceniania. 150h / 25 = 6 ECTS |
| Efekty uczenia się - wiedza: | W1: Zna pojęcia pozwalające określać symetrię cząsteczki, układ krystalograficzny, grupę punktową i przestrzenną. W2: Zna etapy pomiaru dyfraktometrycznego. W3: Zna metody rozwiązania problemu fazowego W4: Zna obsługę programów do wizualizacji struktur związków małocząsteczkowych. K_W01, K_W06, K_W12 |
| Efekty uczenia się - umiejętności: | U1: Potrafi wybrać dobrej jakości monokryształ do badań strukturalnych. U2: Potrafi zaplanować eksperyment w celu określenia struktury związków małocząsteczkowych. U3: Potrafi rozwiązać i udokładnić strukturę krystaliczną organicznych związków małocząsteczkowych oraz kompleksów metali d-elektronowych. U4: Potrafi dokonać analizy strukturalnej organicznych związków małocząsteczkowych oraz kompleksów metali d-elektronowych. K_U01, K_U08, K_U09 |
| Efekty uczenia się - kompetencje społeczne: | K1: Zna ograniczenia własnej wiedzy i rozumie potrzebę dalszego poszerzania swojej wiedzy i doskonalenia swoich umiejętności. K2: Potrafi samodzielnie podjąć działania w celu poszerzania i pogłębiania wiedzy chemicznej. K3: Potrafi współdziałać w zespole (przyjmując w nim różne role) i kreatywnie rozwiązywać problemy dotyczące badań naukowych w tym analizy strukturalnej. K_K01, K_K03 |
| Metody dydaktyczne: | Metody podające: wykład informacyjny lub problemowy. Laboratorium komputerowe: aktywne ćwiczenia. |
| Skrócony opis: |
Celem przedmiotu jest zapoznanie studenta z rentgenowską analizą strukturalną monokryształów, która umożliwia dokładne ustalenia struktury małocząsteczkowych związków chemicznych, jak również biomakromolekuł. |
| Pełny opis: |
W ramach zajęć studenci zostaną zapoznani z metodami rozwiązania problemu fazowego dla związków małocząsteczkowych i białek. Przedstawiona zostanie również specyfika i ograniczenia metod krystalografii białek. Studenci na zajęciach poznają wszystkie etapy pomiaru dyfraktometrycznego, od wyboru odpowiedniej jakości monokryształu, przez montowanie na dyfraktometrze, do wykonania pomiaru z użyciem najnowszego oprogramowania. Studenci zdobędą również umiejętność rozwiązywania i udokładniania struktur związków organicznych oraz związków zawierających ciężkie atomy. W ramach zajęć uczestnicy nauczą się także przygotowywania danych strukturalnych do deponowania w bazie danych strukturalnych Cambridge (CSD) oraz walidacji struktury, analizy geometrii i oddziaływań w kryształach związków małocząsteczkowych. |
| Literatura: |
1. T. Penkala, Zarys Krystalografii, PWN Warszawa, 1977, 2. Z. Bojarski, M. Gigla, K. Stróż, M. Surowiec, Krystalografia, PWN, 2014, 3. Z. Trzaska-Durski, H. Trzaska-Durska, Podstawy Krystalografii Strukturalnej i Rentgenowskiej, PWN, 1994, 4. International Tables For X-ray Crystallography. 5. J. Drenth, Principles of Protein X-Ray Crystallography, Springer-Verlag, 2010. |
| Metody i kryteria oceniania: |
Zaliczenie laboratorium komputerowego na podstawie obecności oraz raportu z wykonanego w trakcie zajęć zadania. Student musi otrzymać 50% punktów możliwych do zdobycie. Egzamin pisemny oceniany w procentach. |
| Praktyki zawodowe: |
Nie dotyczy |
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu.