Analiza in silico mutacji w DNA

Zrozumienie treści zawartych w programie następujących przedmiotów:

- matematyka,

- język angielski,

- biochemia ogólna i podstawy metabolizmu komórkowego.

przedmiot fakultatywny

1. Nakład pracy związany z zajęciami wymagającymi bezpośredniego udziału nauczycieli akademickich wynosi:

- wykłady: 0 h

- seminaria: 0 h

- ćwiczenia : 15 h

- konsultacje związane z przygotowaniem do ćwiczeń: 5 h

- przeprowadzenie zaliczenia: 1 h

- Nakład pracy studenta związany z zajęciami wymagającymi bezpośredniego udziału nauczycieli akademickich wynosi 21 h, co odpowiada 0.84 punktom ECTS

2. Bilans nakładu pracy studenta:

- wykłady: 0 h

- seminaria: 0 h

- ćwiczenia: 15 h

- przygotowanie do zajęć: 24 h

- czytanie literatury fachowej: 10 h

- konsultacje: 5 h

- przygotowanie do zaliczenia i zaliczenie: 20 h + 1 h = 21 h

- Łączny nakład pracy studenta wynosi 75 h, co odpowiada 3 punktom ECTS

3. Nakład pracy studenta związany z prowadzonymi badaniami naukowymi:

- czytanie literatury fachowej: 10 h

- konsultacje badawczo-naukowe: 1 h

- udział w wykładach (z uwzględnieniem metodologii badań naukowych, wyników badań, opracowań): 0h

- udział w seminariach (z uwzględnieniem metodologii badań naukowych, wyników badań, opracowań): 0 h

- udział w ćwiczeniach objętych aktywnością naukową

(z uwzględnieniem metodologii badań naukowych, wyników badań, opracowań): 15 h

- przygotowanie do zajęć objętych aktywnością naukową: 10 h

- przygotowanie do zaliczenia w zakresie aspektów badawczo-naukowych dla danego przedmiotu: 10 h

Łączny nakład pracy studenta związany z prowadzonymi badaniami naukowymi wynosi 46 h, co odpowiada 1.84 punktom ECTS

4. Czas wymagany do przygotowania się i do uczestnictwa w procesie oceniania:

- przygotowanie do zaliczenia + zaliczenie: 20 + 1 = 21 h (0.84 punktu ECTS)

Łączny nakład pracy studenta związany z przygotowaniem się do uczestnictwa w procesie oceniania wynosi 21 godzin, co odpowiada 0.84 punktom ECTS

5. Bilans nakładu pracy studenta o charakterze praktycznym:

- Udział w ćwiczeniach audytoryjnych: 0h

Łączny nakład pracy studenta o charakterze praktycznym wynosi 0 h, co odpowiada 0 punktom ECTS

6. Czas wymagany do odbycia obowiązkowej praktyki:

Nie dotyczy

W1: Ma podstawową wiedzę w zakresie stosowania nowoczesnych biotechnologii w rutynowej diagnostyce laboratoryjnej i rozumie ich przydatność kliniczną (K_W06)

W2: Rozumie znaczenie powiązań studiowanego kierunku studiów z kierunkami biomedycznymi i kierunkami nauk ścisłych (K_W10)

U1: Potrafi pozyskać informacje naukowe wykorzystując zaawansowane bazy danych, w tym bazy danych rejestrujące badania przedkliniczne i kliniczne (K_U01, K_U13)

U2: Biegle wykorzystuje pozyskane informacje naukowe, potrafi je integrować, dokonywać krytycznej interpretacji, a także wyciągać wnioski i stawiać hipotezy robocze (K_U06)

K1: Ma świadomość poziomu swojej wiedzy i umiejętności, rozumie potrzebę ciągłego dokształcania się zawodowego i rozwoju osobistego (K_K01)

Dyskusja, instruktaż

- ćwiczeniowa
- klasyczna metoda problemowa

Zajęcia fakultatywne "Analiza in silico mutacji w DNA" mają na celu zapoznanie studentów z narzędziami bioinformatycznymi mającymi zastosowanie w analizie mutacji występujących w DNA. Podczas zajęć studenci będą wykonywać zadania polegające na scharakteryzowaniu zmian nukleotydowych w DNA oraz określeniu ich potencjalnego wpływu na metabolizm komórek.

Zajęcia fakultatywne "Analiza in silico mutacji w DNA" mają na celu zapoznanie studentów z narzędziami bioinformatycznymi mającymi zastosowanie w analizie mutacji występujących w DNA. Podczas zajęć studenci zapoznają się z międzynarodowymi wytycznymi dot. zapisu mutacji w DNA oraz będą wykonywać zadania polegające na scharakteryzowaniu zmian nukleotydowych w DNA oraz określeniu ich potencjalnego wpływu na metabolizm komórek. Wynikiem końcowym będzie określenie stopnia patogenności mutacji w DNA wg referencyjnych kryteriów diagnostycznych rekomendowanych przez Amerykańskie Kolegium Genetyki i Genomiki Medycznej.

Literatura podstawowa:

1. A. D. Baxevanis i B. F. F. Quellette “Bioinformatyka. Podręcznik do analizy genów i białek” PWN P.G. Higgs i T.K. Attword "Bioinformatyka i ewolucja molekularna" PWN

Literatura uzupełniająca:

1. Inne publikacje wskazane przez prowadzącego

Zestaw zadań do wykonania oraz opracowanie karty ćwiczeń - ocena w zakresie 2 do 5.