Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu - Centralny punkt logowania
Strona główna

Mikrobiologia ogólna z elementami mikrobiologii medycznej

Informacje ogólne

Kod przedmiotu: 1600-BM22MIKO-1
Kod Erasmus / ISCED: 13.0 Kod klasyfikacyjny przedmiotu składa się z trzech do pięciu cyfr, przy czym trzy pierwsze oznaczają klasyfikację dziedziny wg. Listy kodów dziedzin obowiązującej w programie Socrates/Erasmus, czwarta (dotąd na ogół 0) – ewentualne uszczegółowienie informacji o dyscyplinie, piąta – stopień zaawansowania przedmiotu ustalony na podstawie roku studiów, dla którego przedmiot jest przeznaczony. / (0512) Biochemia Kod ISCED - Międzynarodowa Standardowa Klasyfikacja Kształcenia (International Standard Classification of Education) została opracowana przez UNESCO.
Nazwa przedmiotu: Mikrobiologia ogólna z elementami mikrobiologii medycznej
Jednostka: Katedra Mikrobiologii
Grupy: Przedmioty obowiazkowe dla 2 semestru 2 roku S1 kierunku biotechnologia medyczna
Punkty ECTS i inne: 5.00 Podstawowe informacje o zasadach przyporządkowania punktów ECTS:
  • roczny wymiar godzinowy nakładu pracy studenta konieczny do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się dla danego etapu studiów wynosi 1500-1800 h, co odpowiada 60 ECTS;
  • tygodniowy wymiar godzinowy nakładu pracy studenta wynosi 45 h;
  • 1 punkt ECTS odpowiada 25-30 godzinom pracy studenta potrzebnej do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się;
  • tygodniowy nakład pracy studenta konieczny do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się pozwala uzyskać 1,5 ECTS;
  • nakład pracy potrzebny do zaliczenia przedmiotu, któremu przypisano 3 ECTS, stanowi 10% semestralnego obciążenia studenta.
Język prowadzenia: polski
Wymagania wstępne:

Chemia ogólna, nieorganiczna, organiczna, biologia komórki, biochemia ogólna i podstawy metabolizmu komórkowego, podstawy biotechnologii.

Rodzaj przedmiotu:

przedmiot obowiązkowy

Całkowity nakład pracy studenta:

1. Nakład pracy związany z zajęciami wymagającymi bezpośredniego udziału nauczycieli akademickich wynosi:

– udział w wykładach: 30 godzin

– udział w ćwiczeniach: 30godzin

– udział w seminariach: nie dotyczy

– udział w konsultacjach naukowo-badawczych: 2 godziny

– udział w egzaminie: 1 godzina

Nakład pracy związany z zajęciami wymagającymi bezpośredniego udziału nauczycieli akademickich wynosi 63 godzin, co odpowiada 2,5 punktom ECTS


2. Bilans nakładu pracy studenta:

– udział w wykładach: 30 godzin

– udział w ćwiczeniach: 30 godzin

– udział w seminariach: nie dotyczy

– udział w konsultacjach naukowo-badawczych: 2 godziny

– przygotowanie do ćwiczeń (w tym czytanie wybranego piśmiennictwa naukowego): 15 godzin

– przygotowanie do kolokwiów: 20 godzin

– przygotowanie do egzaminu i obecność na egzaminie: 27 + 1= 28 godzin


Łączny nakład pracy studenta związany z realizacją przedmiotu wynosi 125 godzin, co odpowiada 4 punktom ECTS

3. Nakład pracy związany z prowadzonymi badaniami naukowymi

– nie dotyczy.


4. Czas wymagany do przygotowania się i do uczestnictwa w procesie oceniania:

– przygotowanie do ćwiczeń (w tym czytanie wybranego piśmiennictwa naukowego): 15 godzin

– przygotowanie do kolokwiów: 20 godzin

– przygotowanie do egzaminu i obecność na egzaminie: 27 + 1= 28 godzin

Łączny nakład pracy studenta związany z przygotowaniem do uczestnictwa w procesie oceniania wynosi 63 godzin co odpowiada 2,5 punktu ECTS


5. Bilans nakładu pracy o charakterze praktycznym

– udział w ćwiczeniach: 30 godzin

Łączny nakład pracy studenta o charakterze praktycznym wynosi 30 godzin, co odpowiada 1,2 punku ECTS


6. Czas wymagany do odbycia obowiązkowej praktyki

– nie dotyczy

Efekty uczenia się - wiedza:

W1: ma wiedzę na temat mikroorganizmów i możliwości ich wykorzystania w procesach biotechnologicznych - K_W08

W2: rozumie znaczenie pracy doświadczalnej w biotechnologii K_W13

W3: zna zasady pracy w pracowniach biologicznych. Zna obowiązujące w nich przepisy BHP, potrafi określić zagrożenia i sposoby ich zapobiegania - K_W19


Efekty uczenia się - umiejętności:

U1: stosuje podstawowe narzędzia badawcze i techniki właściwe dla nauk biologicznych i medycznych - K_U01

U2: Rozumie literaturę z zakresu biotechnologii w języku polskim, czyta ze zrozumieniem literaturę fachową/proste teksty naukowe w języku angielskim – K_U02

Efekty uczenia się - kompetencje społeczne:

K1: potrafi współdziałać i pracować w grupie - K_K04

K2: jest odpowiedzialny za własną pracę i powierzony sprzęt, szanuje pracę własną i innych – K_K05

Metody dydaktyczne:

Wykład:

- wykład informacyjny (konwencjonalny) z prezentacją multimedialną

- wykład konwersatoryjny, dyskusja


Ćwiczenia:

- metoda klasyczna problemowa

- metody eksponujące: metoda pokazu

- metoda laboratoryjna, eksperymentu

- metoda dyskusji

- przedłużona obserwacja


Seminaria:

- nie dotyczy.

Metody dydaktyczne eksponujące:

- pokaz

Metody dydaktyczne podające:

- wykład informacyjny (konwencjonalny)
- wykład konwersatoryjny
- wykład problemowy

Metody dydaktyczne poszukujące:

- doświadczeń
- klasyczna metoda problemowa
- laboratoryjna
- obserwacji
- okrągłego stołu

Metody dydaktyczne w kształceniu online:

- metody służące prezentacji treści

Skrócony opis:

Wykłady mają na celu:

1. Zapoznanie z zasadami pracy w laboratorium mikrobiologicznym i poziomami bezpieczeństwa biologicznego.

2. Zapoznanie z morfologią drobnoustrojów oraz metodami ich badania.

3. Omówienie chorobotwórczości drobnoustrojów i podstawowych pojęć z tym związanych.

4. Wprowadzenie do zagadnień immunologii infekcyjnej oraz immunoprofilaktyki.

5. Charakterystyka najważniejszych grup antybiotyków, mechanizmów antybiotykooporności drobnoustrojów na leki przeciwdrobnoustrojowe i metod ich wykrywania.

Ćwiczenia mają na celu:

1. Zaznajomienie z właściwościami biologicznymi i podstawowymi metodami hodowli, identyfikacji i oceny antybiotykowrażliwości drobnoustrojów.

2. Przybliżenie podstawowych metod biologii molekularnej wykorzystywanych w diagnostyce mikrobiologicznej.

3. Charakterystykę metod fenotypowania i genotypowania drobnoustrojów.

4. Wypracowanie umiejętności pracy indywidualnej i zespołowej.

Pełny opis:

Wykłady z przedmiotu Mikrobiologia ogólna z elementami mikrobiologii medycznej mają na celu zdobycie wiedzy z zakresu: morfologii wirusów, bakterii i grzybów, metod hodowli, identyfikacji drobnoustrojów, metod oznaczania ich antybiotykowrażliwości i wykrywania lekooporności, metod typowania drobnoustrojów stosowanych w dochodzeniach epidemiologicznych, środków dezynfekcyjnych i aseptycznych oraz zasad profilaktyki zakażeń.

Ćwiczenia (laboratoria) są częściowo powiązane z zagadnieniami omawianymi na wykładach i mają na celu nabycie umiejętności praktycznych z zakresu podstawowej diagnostyki mikrobiologicznej; zaznajomienie z podstawowymi metodami hodowli, identyfikacji i oceny antybiotykowrażliwości drobnoustrojów, przybliżenie podstawowych metod biologii molekularnej wykorzystywanych w diagnostyce mikrobiologicznej, zapoznanie z metodami fenotypowania i genotypowania drobnoustrojów oraz wypracowanie umiejętności pracy indywidualnej i zespołowej. Podczas zajęć studenci zostają zapoznani z metodami identyfikacji drobnoustrojów i oceny ich antybiotykowrażliwości, zasadami aseptyki, antyseptyki i pracy w medycznym laboratorium mikrobiologicznym. Metody molekularne w identyfikacji i typowaniu drobnoustrojów.

Treści programowe wykładów:

Przedmiot i historia mikrobiologii. Morfologia drobnoustrojów: budowa komórki bakteryjnej, morfologia kolonii, typ wzrostu na podłożu płynnym. Elementy genetyki drobnoustrojów. Źródła zmienności drobnoustrojów: mutacje, rekombinacje (koniugacja, transdukcja, transformacja). Charakterystyka bakteriofagów. Wpływ czynników fizycznych i chemicznych na drobnoustroje. Podział laboratoriów ze względu na poziom bezpieczeństwa biologicznego. Elementy immunologii infekcyjnej. Metody identyfikacji drobnoustrojów (hodowla, reakcje biochemiczne, reakcja antygen–przeciwciało, spektrometria mas) Metody molekularne w identyfikacji i typowaniu drobnoustrojów. Chorobotwórczość drobnoustrojów. Podział i charakterystyka toksyn. Elementy immunoprofilaktyki. Szczepionki – podział, nowe kierunki badań, przykłady zastosowania. Leki przeciwdrobnoustrojowe – podział, charakterystyka i mechanizmy działania antybiotyków i chemioterapeutyków. Mechanizmy oporności drobnoustrojów na antybiotyki. Charakterystyka i metody wykrywania beta-laktamaz bakteryjnych. Charakterystyka wybranych leków przeciwwirusowych i przeciwgrzybiczych oraz mechanizmy ich działania i oporności na nie.

Treści programowe ćwiczeń:

Zasady BHP obowiązujące w laboratorium mikrobiologicznym. Budowa i rodzaje mikroskopów. Zasady mikroskopowania. Budowa komórki bakteryjnej. Metody barwienia drobnoustrojów. Barwienie struktur komórkowych. Metody hodowli drobnoustrojów. Metody identyfikacji drobnoustrojów (metody biochemiczne manualne i automatyczne, metody serologiczne). Fenotypowe metody oznaczania antybiotykowrażliwości drobnoustrojów. Metody wykrywania mechanizmów oporności na antybiotyki u bakterii. Genetyczne metody wykrywania u bakterii mechanizmów oporności na antybiotyki. Podstawy dezynfekcji i sterylizacji – podstawowe definicje, charakterystyka środków dezynfekcyjnych i technik sterylizacji. Metody typowania drobnoustrojów oparte na kwasach nukleinowych – PCR (metody izolacji DNA, doboru warunków reakcji PCR i elektroforeza agarozowa produktów amplifikacji. Charakterystyka elektroforezy pulsacyjnej (PFGE): izolacja DNA chromosomalnego, analiza długości fragmentów restrykcyjnych wg kryteriów Tenovera. Omówienie metod diagnostyki wybranych zakażeń wirusowych.

Literatura:

Piśmiennictwo obowiązkowe:

1. Murray P.R., Rosenthal K.S., Pfaller M.A.: Mikrobiologia. Edra Urban and Partner, Wrocław, 2018 (lub wyd. wcześniejsze)

Piśmiennictwo uzupełniające:

1. Libudzisz Z., Kowal K., Żakowska Z.: Mikrobiologia techniczna. T. 1 Mikroorganizmy i środowiska ich występowania. PWN, Warszawa, 2012

2. Dzierżanowska D. Antybiotykoterapia praktyczna. Bielsko-Biała, 2018

3. Markiewicz Z, Kwiatkowski ZA. Bakterie, antybiotyki, lekooporność. PWN, Warszawa, 2021.

4. Singleton P. Bakterie w biologii, biotechnologii i medycynie. PWN, Warszawa, 2000

Metody i kryteria oceniania:

Kolokwium: W1, W2, W3, U1,

Praktyczne wykonanie ćwiczeń: W1, W2, W3, U1, K1

Egzamin pisemny (test, pytania zamknięte, odpowiedzi jednokrotnego wyboru) (zaliczenie ≥ 60%) – W1, W2, W3, U1

Jeżeli średnia ocen studenta z laboratoriów (średnia ważona wyliczana z ocen za: aktywność [x1], wejściówki [x1], kolokwia [x3]) mieści się w przedziale 4,0 - 4,49, student może mieć dodatkowo doliczone do punktacji z egzaminu 3 punkty. Średnia ocen (z laboratoriów) ≥ 4,5 pozwala dodatkowo doliczyć studentowi 4 punkty do punktacji uzyskanej z egzaminu, co może wpłynąć na podwyższenie oceny końcowej z egzaminu.

W przypadku zaliczeń pisemnych (krótkie sprawdziany na ćwiczeniach, testy na kolokwiach i egzaminie) uzyskane punkty przelicza się na stopnie według następującej skali:

Procent punktów Ocena

92≤…<100% Bardzo dobry

88≤…<92% Dobry plus

80≤…<88% Dobry

71≤…<80% Dostateczny plus

60≤…<71% Dostateczny

<60% Niedostateczny

Przedłużona obserwacja/Aktywność (1-3 punktów; 3 punkty = ocena bardzo dobry)

Praktyki zawodowe:

Nie dotyczy

Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2021/22" (zakończony)

Okres: 2022-02-21 - 2022-09-30
Wybrany podział planu:
Przejdź do planu
Typ zajęć:
Ćwiczenia, 30 godzin więcej informacji
Wykład, 30 godzin więcej informacji
Koordynatorzy: Agnieszka Mikucka
Prowadzący grup: Tomasz Bogiel, Anna Budzyńska, Agnieszka Mikucka
Lista studentów: (nie masz dostępu)
Zaliczenie: Egzamin

Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2022/23" (zakończony)

Okres: 2023-02-20 - 2023-09-30
Wybrany podział planu:
Przejdź do planu
Typ zajęć:
Ćwiczenia, 30 godzin więcej informacji
Wykład, 30 godzin więcej informacji
Koordynatorzy: Agnieszka Mikucka
Prowadzący grup: Tomasz Bogiel, Anna Budzyńska, Katarzyna Grudlewska-Buda, Joanna Kwiecińska-Piróg, Agnieszka Mikucka, Natalia Wiktorczyk-Kapischke
Lista studentów: (nie masz dostępu)
Zaliczenie: Egzamin

Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2023/24" (w trakcie)

Okres: 2024-02-20 - 2024-09-30
Wybrany podział planu:
Przejdź do planu
Typ zajęć:
Ćwiczenia, 30 godzin więcej informacji
Wykład, 30 godzin więcej informacji
Koordynatorzy: Agnieszka Mikucka
Prowadzący grup: Anna Budzyńska, Katarzyna Grudlewska-Buda, Agnieszka Mikucka
Lista studentów: (nie masz dostępu)
Zaliczenie: Egzamin
Opisy przedmiotów w USOS i USOSweb są chronione prawem autorskim.
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu.
ul. Jurija Gagarina 11, 87-100 Toruń tel: +48 56 611-40-10 https://usosweb.umk.pl/ kontakt deklaracja dostępności USOSweb 7.0.2.0-1 (2024-03-12)