Mikrobiologia ogólna z elementami mikrobiologii medycznej
Informacje ogólne
Kod przedmiotu: | 1600-BM22MIKO-1 |
Kod Erasmus / ISCED: |
13.0
|
Nazwa przedmiotu: | Mikrobiologia ogólna z elementami mikrobiologii medycznej |
Jednostka: | Katedra Mikrobiologii |
Grupy: |
Przedmioty obowiazkowe dla 2 semestru 2 roku S1 kierunku biotechnologia medyczna |
Punkty ECTS i inne: |
5.00
|
Język prowadzenia: | polski |
Wymagania wstępne: | Chemia ogólna, nieorganiczna, organiczna, biologia komórki, biochemia ogólna i podstawy metabolizmu komórkowego, podstawy biotechnologii. |
Rodzaj przedmiotu: | przedmiot obowiązkowy |
Całkowity nakład pracy studenta: | 1. Nakład pracy związany z zajęciami wymagającymi bezpośredniego udziału nauczycieli akademickich wynosi: – udział w wykładach: 30 godzin – udział w ćwiczeniach: 30godzin – udział w seminariach: nie dotyczy – udział w konsultacjach naukowo-badawczych: 2 godziny – udział w egzaminie: 1 godzina Nakład pracy związany z zajęciami wymagającymi bezpośredniego udziału nauczycieli akademickich wynosi 63 godzin, co odpowiada 2,5 punktom ECTS 2. Bilans nakładu pracy studenta: – udział w wykładach: 30 godzin – udział w ćwiczeniach: 30 godzin – udział w seminariach: nie dotyczy – udział w konsultacjach naukowo-badawczych: 2 godziny – przygotowanie do ćwiczeń (w tym czytanie wybranego piśmiennictwa naukowego): 15 godzin – przygotowanie do kolokwiów: 20 godzin – przygotowanie do egzaminu i obecność na egzaminie: 27 + 1= 28 godzin Łączny nakład pracy studenta związany z realizacją przedmiotu wynosi 125 godzin, co odpowiada 4 punktom ECTS 3. Nakład pracy związany z prowadzonymi badaniami naukowymi – nie dotyczy. 4. Czas wymagany do przygotowania się i do uczestnictwa w procesie oceniania: – przygotowanie do ćwiczeń (w tym czytanie wybranego piśmiennictwa naukowego): 15 godzin – przygotowanie do kolokwiów: 20 godzin – przygotowanie do egzaminu i obecność na egzaminie: 27 + 1= 28 godzin Łączny nakład pracy studenta związany z przygotowaniem do uczestnictwa w procesie oceniania wynosi 63 godzin co odpowiada 2,5 punktu ECTS 5. Bilans nakładu pracy o charakterze praktycznym – udział w ćwiczeniach: 30 godzin Łączny nakład pracy studenta o charakterze praktycznym wynosi 30 godzin, co odpowiada 1,2 punku ECTS 6. Czas wymagany do odbycia obowiązkowej praktyki – nie dotyczy |
Efekty uczenia się - wiedza: | W1: ma wiedzę na temat mikroorganizmów i możliwości ich wykorzystania w procesach biotechnologicznych - K_W08 W2: rozumie znaczenie pracy doświadczalnej w biotechnologii K_W13 W3: zna zasady pracy w pracowniach biologicznych. Zna obowiązujące w nich przepisy BHP, potrafi określić zagrożenia i sposoby ich zapobiegania - K_W19 |
Efekty uczenia się - umiejętności: | U1: stosuje podstawowe narzędzia badawcze i techniki właściwe dla nauk biologicznych i medycznych - K_U01 U2: Rozumie literaturę z zakresu biotechnologii w języku polskim, czyta ze zrozumieniem literaturę fachową/proste teksty naukowe w języku angielskim – K_U02 |
Efekty uczenia się - kompetencje społeczne: | K1: potrafi współdziałać i pracować w grupie - K_K04 K2: jest odpowiedzialny za własną pracę i powierzony sprzęt, szanuje pracę własną i innych – K_K05 |
Metody dydaktyczne: | Wykład: - wykład informacyjny (konwencjonalny) z prezentacją multimedialną - wykład konwersatoryjny, dyskusja Ćwiczenia: - metoda klasyczna problemowa - metody eksponujące: metoda pokazu - metoda laboratoryjna, eksperymentu - metoda dyskusji - przedłużona obserwacja Seminaria: - nie dotyczy. |
Metody dydaktyczne eksponujące: | - pokaz |
Metody dydaktyczne podające: | - wykład informacyjny (konwencjonalny) |
Metody dydaktyczne poszukujące: | - doświadczeń |
Metody dydaktyczne w kształceniu online: | - metody służące prezentacji treści |
Skrócony opis: |
Wykłady mają na celu: 1. Zapoznanie z zasadami pracy w laboratorium mikrobiologicznym i poziomami bezpieczeństwa biologicznego. 2. Zapoznanie z morfologią drobnoustrojów oraz metodami ich badania. 3. Omówienie chorobotwórczości drobnoustrojów i podstawowych pojęć z tym związanych. 4. Wprowadzenie do zagadnień immunologii infekcyjnej oraz immunoprofilaktyki. 5. Charakterystyka najważniejszych grup antybiotyków, mechanizmów antybiotykooporności drobnoustrojów na leki przeciwdrobnoustrojowe i metod ich wykrywania. Ćwiczenia mają na celu: 1. Zaznajomienie z właściwościami biologicznymi i podstawowymi metodami hodowli, identyfikacji i oceny antybiotykowrażliwości drobnoustrojów. 2. Przybliżenie podstawowych metod biologii molekularnej wykorzystywanych w diagnostyce mikrobiologicznej. 3. Charakterystykę metod fenotypowania i genotypowania drobnoustrojów. 4. Wypracowanie umiejętności pracy indywidualnej i zespołowej. |
Pełny opis: |
Wykłady z przedmiotu Mikrobiologia ogólna z elementami mikrobiologii medycznej mają na celu zdobycie wiedzy z zakresu: morfologii wirusów, bakterii i grzybów, metod hodowli, identyfikacji drobnoustrojów, metod oznaczania ich antybiotykowrażliwości i wykrywania lekooporności, metod typowania drobnoustrojów stosowanych w dochodzeniach epidemiologicznych, środków dezynfekcyjnych i aseptycznych oraz zasad profilaktyki zakażeń. Ćwiczenia (laboratoria) są częściowo powiązane z zagadnieniami omawianymi na wykładach i mają na celu nabycie umiejętności praktycznych z zakresu podstawowej diagnostyki mikrobiologicznej; zaznajomienie z podstawowymi metodami hodowli, identyfikacji i oceny antybiotykowrażliwości drobnoustrojów, przybliżenie podstawowych metod biologii molekularnej wykorzystywanych w diagnostyce mikrobiologicznej, zapoznanie z metodami fenotypowania i genotypowania drobnoustrojów oraz wypracowanie umiejętności pracy indywidualnej i zespołowej. Podczas zajęć studenci zostają zapoznani z metodami identyfikacji drobnoustrojów i oceny ich antybiotykowrażliwości, zasadami aseptyki, antyseptyki i pracy w medycznym laboratorium mikrobiologicznym. Metody molekularne w identyfikacji i typowaniu drobnoustrojów. Treści programowe wykładów: Przedmiot i historia mikrobiologii. Morfologia drobnoustrojów: budowa komórki bakteryjnej, morfologia kolonii, typ wzrostu na podłożu płynnym. Elementy genetyki drobnoustrojów. Źródła zmienności drobnoustrojów: mutacje, rekombinacje (koniugacja, transdukcja, transformacja). Charakterystyka bakteriofagów. Wpływ czynników fizycznych i chemicznych na drobnoustroje. Podział laboratoriów ze względu na poziom bezpieczeństwa biologicznego. Elementy immunologii infekcyjnej. Metody identyfikacji drobnoustrojów (hodowla, reakcje biochemiczne, reakcja antygen–przeciwciało, spektrometria mas) Metody molekularne w identyfikacji i typowaniu drobnoustrojów. Chorobotwórczość drobnoustrojów. Podział i charakterystyka toksyn. Elementy immunoprofilaktyki. Szczepionki – podział, nowe kierunki badań, przykłady zastosowania. Leki przeciwdrobnoustrojowe – podział, charakterystyka i mechanizmy działania antybiotyków i chemioterapeutyków. Mechanizmy oporności drobnoustrojów na antybiotyki. Charakterystyka i metody wykrywania beta-laktamaz bakteryjnych. Charakterystyka wybranych leków przeciwwirusowych i przeciwgrzybiczych oraz mechanizmy ich działania i oporności na nie. Treści programowe ćwiczeń: Zasady BHP obowiązujące w laboratorium mikrobiologicznym. Budowa i rodzaje mikroskopów. Zasady mikroskopowania. Budowa komórki bakteryjnej. Metody barwienia drobnoustrojów. Barwienie struktur komórkowych. Metody hodowli drobnoustrojów. Metody identyfikacji drobnoustrojów (metody biochemiczne manualne i automatyczne, metody serologiczne). Fenotypowe metody oznaczania antybiotykowrażliwości drobnoustrojów. Metody wykrywania mechanizmów oporności na antybiotyki u bakterii. Genetyczne metody wykrywania u bakterii mechanizmów oporności na antybiotyki. Podstawy dezynfekcji i sterylizacji – podstawowe definicje, charakterystyka środków dezynfekcyjnych i technik sterylizacji. Metody typowania drobnoustrojów oparte na kwasach nukleinowych – PCR (metody izolacji DNA, doboru warunków reakcji PCR i elektroforeza agarozowa produktów amplifikacji. Charakterystyka elektroforezy pulsacyjnej (PFGE): izolacja DNA chromosomalnego, analiza długości fragmentów restrykcyjnych wg kryteriów Tenovera. Omówienie metod diagnostyki wybranych zakażeń wirusowych. |
Literatura: |
Piśmiennictwo obowiązkowe: 1. Murray P.R., Rosenthal K.S., Pfaller M.A.: Mikrobiologia. Edra Urban and Partner, Wrocław, 2018 (lub wyd. wcześniejsze) Piśmiennictwo uzupełniające: 1. Libudzisz Z., Kowal K., Żakowska Z.: Mikrobiologia techniczna. T. 1 Mikroorganizmy i środowiska ich występowania. PWN, Warszawa, 2012 2. Dzierżanowska D. Antybiotykoterapia praktyczna. Bielsko-Biała, 2018 3. Markiewicz Z, Kwiatkowski ZA. Bakterie, antybiotyki, lekooporność. PWN, Warszawa, 2021. 4. Singleton P. Bakterie w biologii, biotechnologii i medycynie. PWN, Warszawa, 2000 |
Metody i kryteria oceniania: |
Kolokwium: W1, W2, W3, U1, Praktyczne wykonanie ćwiczeń: W1, W2, W3, U1, K1 Egzamin pisemny (test, pytania zamknięte, odpowiedzi jednokrotnego wyboru) (zaliczenie ≥ 60%) – W1, W2, W3, U1 Jeżeli średnia ocen studenta z laboratoriów (średnia ważona wyliczana z ocen za: aktywność [x1], wejściówki [x1], kolokwia [x3]) mieści się w przedziale 4,0 - 4,49, student może mieć dodatkowo doliczone do punktacji z egzaminu 3 punkty. Średnia ocen (z laboratoriów) ≥ 4,5 pozwala dodatkowo doliczyć studentowi 4 punkty do punktacji uzyskanej z egzaminu, co może wpłynąć na podwyższenie oceny końcowej z egzaminu. W przypadku zaliczeń pisemnych (krótkie sprawdziany na ćwiczeniach, testy na kolokwiach i egzaminie) uzyskane punkty przelicza się na stopnie według następującej skali: Procent punktów Ocena 92≤…<100% Bardzo dobry 88≤…<92% Dobry plus 80≤…<88% Dobry 71≤…<80% Dostateczny plus 60≤…<71% Dostateczny <60% Niedostateczny Przedłużona obserwacja/Aktywność (1-3 punktów; 3 punkty = ocena bardzo dobry) |
Praktyki zawodowe: |
Nie dotyczy |
Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2021/22" (zakończony)
Okres: | 2022-02-21 - 2022-09-30 |
Przejdź do planu
PN WT ŚR CZ PT |
Typ zajęć: |
Ćwiczenia, 30 godzin
Wykład, 30 godzin
|
|
Koordynatorzy: | Agnieszka Mikucka | |
Prowadzący grup: | Tomasz Bogiel, Anna Budzyńska, Agnieszka Mikucka | |
Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
Zaliczenie: | Egzamin |
Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2022/23" (zakończony)
Okres: | 2023-02-20 - 2023-09-30 |
Przejdź do planu
PN WT ŚR CZ PT |
Typ zajęć: |
Ćwiczenia, 30 godzin
Wykład, 30 godzin
|
|
Koordynatorzy: | Agnieszka Mikucka | |
Prowadzący grup: | Tomasz Bogiel, Anna Budzyńska, Katarzyna Grudlewska-Buda, Joanna Kwiecińska-Piróg, Agnieszka Mikucka, Natalia Wiktorczyk-Kapischke | |
Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
Zaliczenie: | Egzamin |
Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2023/24" (w trakcie)
Okres: | 2024-02-20 - 2024-09-30 |
Przejdź do planu
PN WT ŚR CZ PT |
Typ zajęć: |
Ćwiczenia, 30 godzin
Wykład, 30 godzin
|
|
Koordynatorzy: | Agnieszka Mikucka | |
Prowadzący grup: | Anna Budzyńska, Katarzyna Grudlewska-Buda, Agnieszka Mikucka | |
Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
Zaliczenie: | Egzamin |
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu.