Biochemia strukturalna
Informacje ogólne
Kod przedmiotu: | 2600-BSTBIOT-2-S1 |
Kod Erasmus / ISCED: |
(brak danych)
/
(0512) Biochemia
|
Nazwa przedmiotu: | Biochemia strukturalna |
Jednostka: | Wydział Nauk Biologicznych i Weterynaryjnych |
Grupy: | |
Punkty ECTS i inne: |
3.00
|
Język prowadzenia: | polski |
Wymagania wstępne: | Kursy podstawowe z chemii ogólnej i organicznej oraz biologii komórki |
Rodzaj przedmiotu: | przedmiot obowiązkowy |
Całkowity nakład pracy studenta: | Godziny z udziałem nauczyciela (65 godz.): - udział w wykładach - 20 h - udział w ćwiczeniach – 45 h Czas poświęcony na pracę indywidualna studenta (10 godz.) : - praca własna studenta - 10 h Łączna liczba godzin: 75 godz. (3 ECTS) |
Efekty uczenia się - wiedza: | W1: Zna budowę chemiczną, właściwości i funkcje podstawowych klas związków chemicznych występujących w komórkach organizmów żywych K_W03, K_W09, K_W10 W2: Tłumaczy zależność między strukturą cząsteczek budujących materię ożywioną a ich funkcją K_W10 W3: Zna techniki badawcze stosowane do poznania budowy i właściwości podstawowych klas związków chemicznych występujących w komórkach organizmów żywych K_W15, K_W16 W4: Zna podręczniki i skrypty z zakresu biochemii K_W12 |
Efekty uczenia się - umiejętności: | U1: Przeprowadza analizę jakościową i ilościową biomolekuł K_U01, K_U07, K_U11 U2: Dokumentuje wyniki analiz, interpretuje dane, wyciąga poprawne wnioski K_U03, , K_U05, K_U06, K_U08, K_U12, K_U14 U3: Potrafi znaleźć literaturę z zakresu studiowanego przedmiotu K_U03, K_U15 |
Efekty uczenia się - kompetencje społeczne: | K1: Akceptuje konieczność znajomości metod matematyczno-statystycznych i informatycznych w biochemii K_K02 K2: Jest chętny do pracy zespołowej respektując zdanie innych członków zespołu K_K03; K_K04 K3: Dba o sprzęt, który wykorzystuje w laboratorium K_K09 K4: Rozwija umiejętność krytycznej oceny uzyskanych wyników K_K07 K5: Dostrzega potrzebę pogłębiania wiedzy jako podstawy do rozwoju przyszłej kariery zawodowej K_K01 |
Metody dydaktyczne: | 1. Wykład: wykład informacyjny (konwencjonalny) 2. Ćwiczenia laboratoryjne - studenci pracują w zespołach 2-osobowych. Ćwiczenia wykonują według wcześniej otrzymanych instrukcji pisemnych, po wstępnym omówieniu podstaw teoretycznych i zaplanowaniu pracy. Grupy laboratoryjne powinny liczyć maksymalnie 10 osób. |
Metody dydaktyczne podające: | - wykład informacyjny (konwencjonalny) |
Metody dydaktyczne poszukujące: | - laboratoryjna |
Skrócony opis: |
Treści przedmiotu dotyczą budowy, właściwości i funkcji podstawowych związków budujących komórkę: białek, węglowodanów, kwasów nukleinowych i lipidów. |
Pełny opis: |
Przedmiot umożliwia studentom uzyskanie wiedzy teoretycznej i praktycznej związanej z poznawaniem procesów życiowych na poziomie cząsteczek chemicznych. Wykłady (20 godz.) Chemiczne składniki komórki. Woda jako środowisko dla reakcji biochemicznych. Aminokwasy i białka - budowa, właściwości i funkcje. Cukrowce: podział i nomenklatura, funkcje, monosacharydy, polisacharydy. Budowa i funkcja kwasów nukleinowych(DNA, RNA). Lipidy - zróżnicowanie strukturalne i funkcjonalne. Budowa i funkcje błon biologicznych. Transport przez błony. Ćwiczenia laboratoryjne (45 godzin): ćwiczenia laboratoryjne są podzielone na 3 bloki tematyczne. Każdy blok obejmuje 3 ćwiczenia praktyczne, po których jest sprawdzian pisemny zaliczający dany blok. Pierwszy obejmuje: Aminokwasy i białka (rozdział aminokwasów metodą chromatografii podziałowej, miareczkowanie alaniny, wykonanie reakcji charakterystycznych dla wybranych aminokwasów; ilościowe oznaczanie białek metodą biuretową, wytrącanie kazeiny w punkcie izoelektrycznym, frakcjonowanie białek surowicy krwi metodą wysalania siarczanem amonu, denaturacja białek; rozdział białek zawartych w surowicy krwi metodą elektroforezy w żelu agarozowym, rozdział hemoglobiny od chromianu potasu metodą sączenia żelowego na kolumnie Sephadex G-15 (odsalanie hemoglobiny). Drugi blok dotyczy węglowodanów, DNA, lipidów i fosforanów (analiza jakościowa cukrów; izolowanie jąder komórkowych z etiolowanych siewek pszenicy, preparatyka DNA z wyizolowanych jąder, ocena czystości preparatu DNA na podstawie analizy spektrofotometrycznej, chromatografię cienkowarstwową i identyfikację lipidów oraz ilościowe oznaczanie fosforanu). Trzeci blok obejmuje ćwiczenia z enzymów (kinetyka reakcji enzymatycznych; wpływ pH i temperatury na aktywność arylosulfatazy). |
Literatura: |
Stryer L, Tymoczko JL, Berg JM. Biochemia. PWN, 2007, 2009, 2011, 2018 Murray RK, Granner DK, RodwellVW. Biochemia Harpera. PZWL, 2008 Alberts B i wsp. Podstawy biologii komórki. PWN 2007 Koolman J, Röhm K-H. Biochemia. Ilustrowany przewodnik. Wydawnictwo Lekarskie PZWL, 2005 Kłyszejko-Stefanowicz L i wsp. Ćwiczenia z biochemii. PWN, 2005 Zgirski A, Gondko R. Obliczenia biochemiczne. PWN, 1998 Instrukcje do ćwiczeń - dostępne w Zakładzie Biochemii |
Metody i kryteria oceniania: |
Wykład: egzamin pisemny. Warunkiem przystąpienia do egzaminu jest zaliczenie ćwiczeń na ocenę pozytywną. Laboratorium: każde ćwiczenie laboratoryjne rozpoczyna się krótkim sprawdzianem ustnym lub pisemnym dotyczącym znajomości instrukcji oraz wiedzy potrzebnej do wykonania danego ćwiczenia. Pojedyncze ćwiczenia są zaliczane na podstawie obecności na zajęciach i pozytywnej oceny raportu pisemnego z wykonanego ćwiczenia. Poszczególne bloki ćwiczeniowe kończą się pisemnym kolokwium. Każdy blok ćwiczeniowy musi być zaliczony na ocenę co najmniej dostateczną. Zaliczenie końcowe z ćwiczeń uzyskuje się na podstawie zaliczonych raportów oraz średniej oceny z poszczególnych bloków ćwiczeniow. Przewidziany jest sprawdzian zaliczeniowy poprawkowy dla osób, które nie uzyskały średniej oceny końcowej dostatecznej. Kryteria oceny: wymagany próg na ocenę dostateczną: 50-60%, 61-70% dostateczny plus, 71-80% - dobry, 81-90% - dobry plus, 91-100% - bardzo dobry |
Praktyki zawodowe: |
nie dotyczy |
Zajęcia w cyklu "Semestr zimowy 2021/22" (zakończony)
Okres: | 2021-10-01 - 2022-02-20 |
Przejdź do planu
PN WT LAB
LAB
LAB
ŚR LAB
CZ WYK
PT |
Typ zajęć: |
Laboratorium, 45 godzin
Wykład, 20 godzin
|
|
Koordynatorzy: | Joanna Czarnecka | |
Prowadzący grup: | Anna Ciarkowska, Joanna Czarnecka, Anna Hetmann, Dorota Nemecz, Barbara Wojczuk | |
Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
Zaliczenie: | Egzamin | |
Skrócony opis: |
Treści przedmiotu dotyczą budowy, właściwości i funkcji podstawowych związków budujących komórkę: białek, węglowodanów, kwasów nukleinowych i lipidów. |
|
Pełny opis: |
Wykłady prowadzone w systemie zdalnym on line, na platformie Microsoft Teams, w formie dwunastu 75 minutowych spotkań (20 godzin lekcyjnych) Ćwiczenia laboratoryjne (45 godzin) realizowane są w trybie hybrydowym, ilość spotkań realizowanych stacjonarnie 5, realizowanych zdalnie 9. Ćwiczenia są podzielone na 3 bloki tematyczne. Każdy blok obejmuje 3 ćwiczenia, przynajmniej jest jedno realizowane jest w systemie stacjonarnym, po których jest sprawdzian pisemny zaliczający dany blok. Pierwszy obejmuje: Aminokwasy i białka (rozdział aminokwasów metodą chromatografii podziałowej, miareczkowanie alaniny, wykonanie reakcji charakterystycznych dla wybranych aminokwasów; ilościowe oznaczanie białek metodą biuretową, wytrącanie kazeiny w punkcie izoelektrycznym, frakcjonowanie białek surowicy krwi metodą wysalania siarczanem amonu, denaturacja białek; rozdział białek zawartych w surowicy krwi metodą elektroforezy w żelu agarozowym, rozdział hemoglobiny od chromianu potasu metodą sączenia żelowego na kolumnie Sephadex G-15 (odsalanie hemoglobiny). Drugi blok dotyczy węglowodanów, DNA, lipidów i fosforanów (analiza jakościowa cukrów; izolowanie jąder komórkowych z etiolowanych siewek pszenicy, preparatyka DNA z wyizolowanych jąder, ocena czystości preparatu DNA na podstawie analizy spektrofotometrycznej, chromatografię cienkowarstwową i identyfikację lipidów oraz ilościowe oznaczanie fosforanu). Trzeci blok obejmuje ćwiczenia z enzymów (kinetyka reakcji enzymatycznych, wpływ jonów na aktywność pirofosfatazy, wykrywanie aktywności oksydoreduktaz oraz oznaczanie aktywności fotochemicznej fotosystemu II w chloroplastach izolowanych z liści sałaty (reakcja Hilla). |
|
Literatura: |
Stryer L, Tymoczko JL, Berg JM. Biochemia. PWN, 2007, 2009, 2011 Murray RK, Granner DK, RodwellVW. Biochemia Harpera. PZWL, 2008 Alberts B i wsp. Podstawy biologii komórki. PWN 2007 Koolman J, Röhm K-H. Biochemia. Ilustrowany przewodnik. Wydawnictwo Lekarskie PZWL, 2005 Kłyszejko-Stefanowicz L i wsp. Ćwiczenia z biochemii. PWN, 2005 Zgirski A, Gondko R. Obliczenia biochemiczne. PWN, 1998 Instrukcje do ćwiczeń - dostępne w Zakładzie Biochemii |
Zajęcia w cyklu "Semestr zimowy 2022/23" (zakończony)
Okres: | 2022-10-01 - 2023-02-19 |
Przejdź do planu
PN WT LAB
LAB
ŚR CZ WYK
PT |
Typ zajęć: |
Laboratorium, 45 godzin
Wykład, 20 godzin
|
|
Koordynatorzy: | Joanna Czarnecka | |
Prowadzący grup: | Joanna Czarnecka, Anna Hetmann, Dorota Nemecz, Barbara Wojczuk | |
Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
Zaliczenie: | Egzamin | |
Skrócony opis: |
Treści przedmiotu dotyczą budowy, właściwości i funkcji podstawowych związków budujących komórkę: białek, węglowodanów, kwasów nukleinowych i lipidów. |
|
Pełny opis: |
Wykłady prowadzone w systemie zdalnym on line, na platformie Microsoft Teams, w formie dwunastu 75 minutowych spotkań (20 godzin lekcyjnych) Ćwiczenia laboratoryjne (45 godzin) realizowane są w trybie hybrydowym, ilość spotkań realizowanych stacjonarnie 5, realizowanych zdalnie 9. Ćwiczenia są podzielone na 3 bloki tematyczne. Każdy blok obejmuje 3 ćwiczenia, przynajmniej jest jedno realizowane jest w systemie stacjonarnym, po których jest sprawdzian pisemny zaliczający dany blok. Pierwszy obejmuje: Aminokwasy i białka (rozdział aminokwasów metodą chromatografii podziałowej, miareczkowanie alaniny, wykonanie reakcji charakterystycznych dla wybranych aminokwasów; ilościowe oznaczanie białek metodą biuretową, wytrącanie kazeiny w punkcie izoelektrycznym, frakcjonowanie białek surowicy krwi metodą wysalania siarczanem amonu, denaturacja białek; rozdział białek zawartych w surowicy krwi metodą elektroforezy w żelu agarozowym, rozdział hemoglobiny od chromianu potasu metodą sączenia żelowego na kolumnie Sephadex G-15 (odsalanie hemoglobiny). Drugi blok dotyczy węglowodanów, DNA, lipidów i fosforanów (analiza jakościowa cukrów; izolowanie jąder komórkowych z etiolowanych siewek pszenicy, preparatyka DNA z wyizolowanych jąder, ocena czystości preparatu DNA na podstawie analizy spektrofotometrycznej, chromatografię cienkowarstwową i identyfikację lipidów oraz ilościowe oznaczanie fosforanu). Trzeci blok obejmuje ćwiczenia z enzymów (kinetyka reakcji enzymatycznych, wpływ jonów na aktywność pirofosfatazy, wykrywanie aktywności oksydoreduktaz oraz oznaczanie aktywności fotochemicznej fotosystemu II w chloroplastach izolowanych z liści sałaty (reakcja Hilla). |
|
Literatura: |
Stryer L, Tymoczko JL, Berg JM. Biochemia. PWN, 2007, 2009, 2011 Murray RK, Granner DK, RodwellVW. Biochemia Harpera. PZWL, 2008 Alberts B i wsp. Podstawy biologii komórki. PWN 2007 Koolman J, Röhm K-H. Biochemia. Ilustrowany przewodnik. Wydawnictwo Lekarskie PZWL, 2005 Kłyszejko-Stefanowicz L i wsp. Ćwiczenia z biochemii. PWN, 2005 Zgirski A, Gondko R. Obliczenia biochemiczne. PWN, 1998 Instrukcje do ćwiczeń - dostępne w Zakładzie Biochemii |
Zajęcia w cyklu "Semestr zimowy 2023/24" (zakończony)
Okres: | 2023-10-01 - 2024-02-19 |
Przejdź do planu
PN LAB
WT LAB
LAB
ŚR LAB
CZ WYK
PT |
Typ zajęć: |
Laboratorium, 45 godzin
Wykład, 20 godzin
|
|
Koordynatorzy: | Joanna Czarnecka | |
Prowadzący grup: | Anna Ciarkowska, Joanna Czarnecka, Anna Hetmann, Dorota Nemecz, Barbara Wojczuk | |
Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
Zaliczenie: | Egzamin | |
Skrócony opis: |
Treści przedmiotu dotyczą budowy, właściwości i funkcji podstawowych związków budujących komórkę: białek, węglowodanów, kwasów nukleinowych i lipidów. |
|
Pełny opis: |
Wykłady prowadzone w systemie zdalnym on line, na platformie Microsoft Teams, w formie dwunastu 75 minutowych spotkań (20 godzin lekcyjnych) Ćwiczenia laboratoryjne (45 godzin) realizowane są w trybie hybrydowym, ilość spotkań realizowanych stacjonarnie 5, realizowanych zdalnie 9. Ćwiczenia są podzielone na 3 bloki tematyczne. Każdy blok obejmuje 3 ćwiczenia, przynajmniej jest jedno realizowane jest w systemie stacjonarnym, po których jest sprawdzian pisemny zaliczający dany blok. Pierwszy obejmuje: Aminokwasy i białka (rozdział aminokwasów metodą chromatografii podziałowej, miareczkowanie alaniny, wykonanie reakcji charakterystycznych dla wybranych aminokwasów; ilościowe oznaczanie białek metodą biuretową, wytrącanie kazeiny w punkcie izoelektrycznym, frakcjonowanie białek surowicy krwi metodą wysalania siarczanem amonu, denaturacja białek; rozdział białek zawartych w surowicy krwi metodą elektroforezy w żelu agarozowym, rozdział hemoglobiny od chromianu potasu metodą sączenia żelowego na kolumnie Sephadex G-15 (odsalanie hemoglobiny). Drugi blok dotyczy węglowodanów, DNA, lipidów i fosforanów (analiza jakościowa cukrów; izolowanie jąder komórkowych z etiolowanych siewek pszenicy, preparatyka DNA z wyizolowanych jąder, ocena czystości preparatu DNA na podstawie analizy spektrofotometrycznej, chromatografię cienkowarstwową i identyfikację lipidów oraz ilościowe oznaczanie fosforanu). Trzeci blok obejmuje ćwiczenia z enzymów (kinetyka reakcji enzymatycznych, wpływ jonów na aktywność pirofosfatazy, wykrywanie aktywności oksydoreduktaz oraz oznaczanie aktywności fotochemicznej fotosystemu II w chloroplastach izolowanych z liści sałaty (reakcja Hilla). |
|
Literatura: |
Stryer L, Tymoczko JL, Berg JM. Biochemia. PWN, 2007, 2009, 2011 Murray RK, Granner DK, RodwellVW. Biochemia Harpera. PZWL, 2008 Alberts B i wsp. Podstawy biologii komórki. PWN 2007 Koolman J, Röhm K-H. Biochemia. Ilustrowany przewodnik. Wydawnictwo Lekarskie PZWL, 2005 Kłyszejko-Stefanowicz L i wsp. Ćwiczenia z biochemii. PWN, 2005 Zgirski A, Gondko R. Obliczenia biochemiczne. PWN, 1998 Instrukcje do ćwiczeń - dostępne w Zakładzie Biochemii |
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu.