Metody analizy niskocząsteczkowych kwasów nukleinowych
Informacje ogólne
Kod przedmiotu: | 2600-DM-MKN-1-S2 |
Kod Erasmus / ISCED: |
(brak danych)
/
(0511) Biologia
|
Nazwa przedmiotu: | Metody analizy niskocząsteczkowych kwasów nukleinowych |
Jednostka: | Wydział Nauk Biologicznych i Weterynaryjnych |
Grupy: | |
Punkty ECTS i inne: |
3.00
|
Język prowadzenia: | polski |
Wymagania wstępne: | Student ma podstawową wiedzę z zakresu biologii komórki, biochemii i genetyki. |
Rodzaj przedmiotu: | przedmiot obowiązkowy |
Całkowity nakład pracy studenta: | Godziny realizowane z udziałem nauczycieli (26 godz.): - udział w wykładach - 8 - udział w ćwiczeniach laboratoryjnych - 18 Czas poświęcony na pracę indywidualną studenta (44 godz.): - przygotowanie do ćwiczeń - 20 - przygotowanie do kolokwiów - 20 - konsultacje i praca z nauczycielem akademickim - 4 Łącznie: 70 godz. (3 ECTS) |
Efekty uczenia się - wiedza: | W1 ma pogłębioną wiedzę teoretyczną dotyczącą biologii molekularnej, w tym metod wykorzystywanych w celach diagnostycznych i badawczych - K_W01 W2: posiada wiedzę z zakresu markerów molekularnych oraz ich wykorzystania do celów diagnostycznych i badawczych - K_W04 W3: zna metody analizy struktury i funkcji komórek oraz badania struktury i aktywności biomolekuł (DNA, RNA i białek) - K_W06 W4 ma pogłębioną wiedzę z dyscyplin kierunkowych umożliwiającą pracę badawczą i działania praktyczne w zakresie diagnostyki molekularnej - K_W19 |
Efekty uczenia się - umiejętności: | U1: wykorzystuje wiedzę dotyczącą struktury i właściwościami biomolekuł (sond molekularnych, przeciwciał, enzymów, rekombinowanych kwasów nukleinowych i białek), w tym cząsteczek chimerowych, do przeprowadzenia analiz diagnostycznych i procesu badawczego - K_U04 U2: proponuje i stosuje właściwe metody identyfikacji biomolekuł oraz techniki badania ich struktury i aktywności - K_U05 U3 potrafi wykorzystać wiedzę dotyczącą możliwości i ograniczeń technik stosowanych w diagnostyce molekularnej - K_U11 U4 posługuje się specjalistyczną terminologią oraz nomenklaturą biologiczną i terminami specjalistycznymi z zakresu biologii molekularnej, biotechnologii, genetyki i inżynierii genetycznej, mikrobiologii i biochemii - K_U13 |
Efekty uczenia się - kompetencje społeczne: | K1: jest odpowiedzialny i zdeterminowany w dążeniu do celu przestrzegając odpowiednich zasad, norm i procedur - K_K02 K2: potrafi pracować w zespole, zarówno kierując i koordynując działania zespołu, jak i wykonując powierzone zadania - K_K09 K3: krytycznie analizuje wyniki własnych badań i badań innych autorów i ma świadomość konieczności podejmowania działań podnoszących wartość badań i zwiększających efektywność pracy - K_K10 |
Metody dydaktyczne: | Metody dydaktyczne podające: - wykład informacyjny z prezentacjami multimedialnymi Metody dydaktyczne poszukujące: - ćwiczenia laboratoryjne: wstęp teoretyczny - prezentacja multimedialna, dyskusja. Cześć praktyczna - wykonywanie zadań zgodnie z instrukcją ćwiczeń w 2-4 osobowych zespołach (zależnie od tematu ćwiczeń), niekiedy pokaz dla całej grupy. Doświadczenia wykonywane przez studentów będą nadzorowane przez osobę prowadzącą zajęcia. Ze względu na bezpieczeństwo i higienę pracy (m.in. szkodliwe odczynniki chemiczne) oraz aparaturę badawczą, konieczne jest prowadzenie zajęć w grupach 8-12 osobowych. Ponadto ograniczona ilość osób w grupach warunkuje możliwość pełnego korzystania przez studentów z laboratorium oraz specjalistycznego sprzętu. |
Metody dydaktyczne eksponujące: | - pokaz |
Metody dydaktyczne podające: | - opis |
Metody dydaktyczne poszukujące: | - ćwiczeniowa |
Skrócony opis: |
Celem przedmiotu jest zapoznanie studentów z rodzajami, biogenezą, technikami analizy niskocząsteczkowego RNA oraz jego wykorzystaniem jako cząsteczki markerowej w diagnostyce molekularnej. |
Pełny opis: |
Treści programowe wykładów będą dotyczyć: dróg biogenezy miRNA, siRNA, tasiRNA i piRNA ze szczelnym uwzględnieniem różnic w tych procesach u roślin i zwierząt; metod analizy niskocząteczkowych RNA takich jak ocena jakości wyizolowanego RNA, ilościowy PCR, RIP (RNA immunopercipitation), sekwencjonowania mikrotrnaskryptomu, technik in situ stosowanych do analizy miRNA. Ponadto poruszone zostaną zagadnienia dotyczące niskocząsteczkowego RNA jako cząsteczki markerowej w: procesie patogenezy, odpowiedzi roślin i zwierząt na stresy biotyczne i abiotyczne oraz poszczególnych etapach rozwoju organizmu. Na zajęciach laboratoryjnych student pozna techniki: izolacji niskocząsteczkowych RNA, elektroforezy w żelu poliakrylamidowym, odwrotnej transkrypcji, rekcji PCR pri-miRNA i dojrzałych miRNA, analizy wewnątrzkomórkowej krótkich RNA i elementów jego biogenezy. Na zajęciach student zapozna się z możliwością zastosowania mutantów funkcyjnych oraz zwierających geny fuzyjne z białkami fluorescencyjnymi w celu badania biogenezy oraz poziomu ekspresji miRNA. |
Literatura: |
1. Allison LA. Podstawy biologii molekularnej. Wydawnictwo Uniwersytetu warszawskiego, 2009; 2. Paddison PJ. Vogt PK. RNA Interference. Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2008; 3. Dalmay T. MicroRNAs in Development. Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2011; |
Metody i kryteria oceniania: |
Metoda oceniania: Zaliczenie na ocenę (test końcowy) - K_W01, K_W04, K_W06, K_W19, aktywność w trakcie zajęć - K_K02, K_K09, K_K03 Kryteria oceniania: - co najmniej 80% frekwencja na zajęciach - wymagany próg (zaliczenie końcowe): 60% - dostateczny 61-68% - dostateczny plus 69-76% - dobry 77-84% - dobry plus 85-100% - bardzo dobry |
Praktyki zawodowe: |
Nie dotyczy |
Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2021/22" (zakończony)
Okres: | 2022-02-21 - 2022-09-30 |
Przejdź do planu
PN LAB
WT WYK
LAB
ŚR CZ PT |
Typ zajęć: |
Laboratorium, 18 godzin
Wykład, 8 godzin
|
|
Koordynatorzy: | Janusz Niedojadło | |
Prowadzący grup: | Dawid Kubiak, Janusz Niedojadło, Katarzyna Niedojadło | |
Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
Zaliczenie: | Zaliczenie na ocenę |
Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2022/23" (zakończony)
Okres: | 2023-02-20 - 2023-09-30 |
Przejdź do planu
PN WYK
WT LAB
ŚR CZ PT |
Typ zajęć: |
Laboratorium, 18 godzin
Wykład, 8 godzin
|
|
Koordynatorzy: | Janusz Niedojadło | |
Prowadzący grup: | Dawid Kubiak, Janusz Niedojadło, Katarzyna Niedojadło | |
Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
Zaliczenie: | Zaliczenie na ocenę |
Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2023/24" (w trakcie)
Okres: | 2024-02-20 - 2024-09-30 |
Przejdź do planu
PN WYK
WT LAB
ŚR CZ PT |
Typ zajęć: |
Laboratorium, 18 godzin
Wykład, 8 godzin
|
|
Koordynatorzy: | Janusz Niedojadło | |
Prowadzący grup: | Janusz Niedojadło, Katarzyna Niedojadło | |
Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
Zaliczenie: | Zaliczenie na ocenę |
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu.