Archeozoologia/zooarcheologia; relacje zwierzęta-człowiek-środowisko w prehistorii, średniowieczu i czasach nowożytnych; historia zwierząt ssaków, ptaków i ryb w Polsce, Europie, Egipcie; historia produktów spożywczych pochodzenia zwierzęcego; znaczenie konia we wczesnośredniowiecznej Polsce.
Osiągnięcia naukowe: autor ponad 300 publikacji w tym pięciu książek; zrelacjonował historię ryb i rybołówstwa w Polsce i Europie Północnej w ostatnich 10 tys. lat - stypendium Aleksander von Humboldt Stiftung (1999-2000); zbadał podstawy gospodarki zwierzętami w grodach wczesnośredniowiecznej Polski; uczestnik interdyscyplinarnych projektów krajowych i międzynarodowych poświęconych m.in. historii rybołówstwa komercyjnego (COST 2014-2018), żubra, tura, jelenia; wykonawca w projekcie Ecology of Crusading (2010-2014), sponsorowanym przez European Research Council; konsultant i kurator wystawy poświęconej historii zwierząt domowych pt. Bliskie, lecz z dalekiego świata Katowice 2019.